基于线粒体基因的NCBI数据库序列在鲑科鱼类品种鉴定中的可靠性分析开题报告

1. 研究目的与意义（文献综述包含参考文献）

1. 鲑科鱼类及其掺假研究现状1.1 鲑科鱼类概述鲑科（salmonidae）隶属于脊索动物门（chordata）鲑形目（salmoniformes），一共包括3个亚科（鲑亚科、茴鱼亚科和白鲑亚科）、7个属（鲑属、大马哈属、哲罗鲑属、红点鲑属、细鳞鲑属、茴鱼属和白鲑属），总共大约有67种鱼。

鲑，硬骨鱼纲鲱形目、鲑科鱼类的统称，世界冷水性重要经济鱼类。

体延长、侧扁，被细小的圆鳞，侧线完全，多数种类的幼鱼体侧有黑斑点。

2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

一、研究的问题本题致力于在ncbi数据库中查找并下载相关品种和对应的线粒体基因序列（包括coi、cytb、16s rrna），并利用cluster、mega,、bio edit等软件将目标dna序列与ncbi上所有与之存在同源性的序列进行对比，分析其可靠性，即基于线粒体基因的ncbi数据库序列在鲑科鱼类品种鉴定中的可靠性分析。

二、设计内容1、从数据库中下载各个品种的，对应基因的序列；2、分析数据中的序列的准确性；3、比较不同基因片段在品种鉴定中的可行性；4、熟练运用mega, bio edit软件。

三、本课题主要的设计方法1、大量搜集网络中优秀的相关课题报告、相关文献等为设计积累一定的知识储备量，阅读一些著名网站完成类似分析的成功案例；2、图书馆查阅序列分析、基因片段分析的相关书籍；3、在ncbi数据库中查找出相关品种以及其对应的线粒体基因序列并下载;3、采用电脑软件的技术方式，利用mega、bio edit等软件对目标dna序列与ncbi上所有与之存在的同源性的序列进行对比，分析可靠性。